Ninja Assassin เนื้อเรื่องของภาพยนตร์นี้มุ่งเน้นไปที่ไรโซ หนึ่งในนินจานักฆ่าที่น่ากลัวและอันตรายที่สุดในโลก ไรโซในวัยเด็กเป็นเด็กเร่ร่อนที่ถูกองค์กรโอซูนูแคลน ซึ่งเป็นองค์กรลับที่หลายคนเชื่อว่าเป็นตำนาน รับมาเลี้ยงและฝึกฝนให้เป็นนักฆ่ามืออาชีพ ไรโซต้องประสบกับความโหดร้ายที่องค์กรนี้กระทำต่อเพื่อนของเขา ทำให้ไรโซตัดสินใจหลบหนีและหายตัวไปจากองค์กร ไรโซใช้เวลาเตรียมตัวและรอคอยโอกาสเพื่อแก้แค้น ขณะที่อยู่ที่เบอร์ลิน สายลับมิกะ โคเรตติพบเบาะแสเกี่ยวกับการเคลื่อนย้ายเงินระหว่างนักฆ่าที่มีเป้าหมายเป็นนักการเมืองและองค์กรนักฆ่าลึกลับจากตะวันออกไกล ภายใต้คำสั่งของผู้บังคับบัญชา มิกะจึงแทรกซึมเข้าสู่ระบบที่ทึบ...